AmneziaVPN, установленный из APK, не обновляется через Google Play
APK с GitHub сам не обновляется и может мешать обновлениям из магазина.
По официальной документации — пересказ, ссылка на страницу-источник ниже.
Что сделать
Удалите приложение и установите его заново из Google Play.